لیسه پگاه برای آسایش و امنیت بهتر و بیشتر دانش آموزان خود، همزمان با تأسیس لیسه در سال ۱۳۹۴ بخش ترانسپورت را نیز فعال کرد. در سال نخست، به دلیل کم بودن تعداد دانش آموز، تنها برای دانش آموزانی که از سمت برچی می آمدند، ترانسپورت در نظر گرفته شده بود. اما با از سال ۱۳۹۵ به این سو، هم به دلیل زیاد شدن تعداد دانش آموز و هم دوشعبه ای شدن مکتب، وسیله های حمل و نقل بیشتری در نظر گرفته شد.

اکنون دانش آموزانی که از ساحات شهرک امید سبز، قلعه شهاده، کارته سه، کارته چهار، کارته سخی، چهار راهی قنبر، خوشحال خان و قلعه نو برچی می آیند، از ترانسپورت مکتب استفاده می کنند و هر روز بدون نگرانی و آسیب، این مسیر را می پیمایند.

هزینه هر مسیر، نظر به میزان دوری آن از مکتب در گرفته شده است. کمترین هزینه مربوط قلعه نو است که ماهانه مبلغ ۳۰۰ افغانی برای هر دانش آموز می باشد. بیشتر ترین هزینه متعلق به دانش آموزانی است که از کارته سخی می آیند. این دانش آموزان ماهانه مبلغ ۱۵۰۰ افغانی پرداخت می کنند. دانش آموزان مسیرهای دیگر بین ۴۰۰ تا ۱۰۰۰ افغانی در ماه پرداخت می کنند.